W momencie gdy mamy w systemie zaimportowane lub wprowadzone ręcznie płatności, ale nie są one połączone z fakturami możemy je połączyć własnoręcznie. 

Możemy to zrobić z poziomu listy płatności za pomocą zielonego przycisku Połącz. 



Po kliknięciu przycisku jeżeli system wcześniej nie próbował połączyć płatności automatycznie system próbuje połączyć płatność szukając faktury, której numer występuje w opisie płatności (jako jedno ze słów, np. "płatność za fakturę 11/333/2017") i o takiej samej kwocie i walucie, co płatność.

Jeśli system próbował wcześniej połączyć z fakturą (ale się nie udało znaleźć), to wyskakuje okienko w które należy wpisać numer faktury do połączenia). Jeśli kliknie się anuluj, to system ponawia automatyczną próbę odnalezienia faktury.

Łączenie płatności może też odbyć się poprzez łączenie pojedynczych płatności i faktur z poziomu edycji danej płatności. 
Służy do tego przycisk Połącz z fakturą. 



Połącz z fakturą (w widoku edycji płatności) - zawsze próbuje powiązać automatycznie.

U góry formatki płatności jest jeszcze wyszukiwarka faktur, dzięki której można samemu ręcznie wskazać z jaką fakturą powinna być powiązana płatność (i nie musi się wtedy zgadzać waluta ani kwota).



Od niedawna system pomija na liście podpowiedzi faktury opłacone. Na liście umieszczone są faktury nieopłacone lub opłacone częściowo. 
Chcąc jednak mieć całą listę faktur razem z opłaconymi należy użyć okna Wyszukaj także opłacone dokumenty.